Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms