Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c2J3QNM1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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