Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm21972J3QN38 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm21972J3QN38 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm21972J3QN38 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Gm21972J3QN38 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Gm21972J3QN38 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm21972J3QN38 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm21972J3QN38 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm21972J3QN38 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21972J3QN38 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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