Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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