Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm3336J3QMQ6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm3336J3QMQ6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm3336J3QMQ6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3336J3QMQ6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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