Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms