Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pot1bH7BX60 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms