Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna9G3X8Z7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna9G3X8Z7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms