Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20517G3UVU6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms