Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srp72F8VQC1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms