Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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