Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Farp1F8VPU2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms