Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms