Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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