Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms