Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r238E9Q373 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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