Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3095E9Q058 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms