Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9972E9Q053 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm9972E9Q053 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm9972E9Q053 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm9972E9Q053 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm9972E9Q053 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm9972E9Q053 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm9972E9Q053 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm9972E9Q053 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm9972E9Q053 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm9972E9Q053 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm9972E9Q053 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm9972E9Q053 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm9972E9Q053 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm9972E9Q053 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm9972E9Q053 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm9972E9Q053 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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