Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc1E9Q043 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc1E9Q043 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms