Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brd1E9PZ26 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms