Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms