Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc175E9PVB3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms