Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gcn1E9PVA8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gcn1E9PVA8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gcn1E9PVA8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gcn1E9PVA8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gcn1E9PVA8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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