Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms