Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmf1B9EKI3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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