Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clip3B9EHT4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms