Protein–RNA interactions for Protein: B7ZMY3

A930018M24Rik, RIKEN cDNA A930018M24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930018M24RikB7ZMY3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
A930018M24RikB7ZMY3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A930018M24RikB7ZMY3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms