Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Phf11bB4XVQ1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Phf11bB4XVQ1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Phf11bB4XVQ1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11bB4XVQ1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms