Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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