Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm6133B2RY53 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms