Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms