Protein–RNA interactions for Protein: B2RV46

Spata6l, Spermatogenesis associated 6-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata6lB2RV46 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Spata6lB2RV46 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spata6lB2RV46 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spata6lB2RV46 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spata6lB2RV46 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spata6lB2RV46 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spata6lB2RV46 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spata6lB2RV46 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Spata6lB2RV46 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Spata6lB2RV46 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms