Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms