Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms