Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed5B2RPU8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms