Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms