Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms