Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Trabd2bB1ATG9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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