Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef20B1ARV6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef20B1ARV6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef20B1ARV6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef20B1ARV6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef20B1ARV6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef20B1ARV6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef20B1ARV6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef20B1ARV6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef20B1ARV6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef20B1ARV6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef20B1ARV6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef20B1ARV6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms