Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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