Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll11A4Q9F4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms