Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palm3A2TJV2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palm3A2TJV2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palm3A2TJV2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palm3A2TJV2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palm3A2TJV2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palm3A2TJV2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palm3A2TJV2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palm3A2TJV2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms