Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms