Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Patl2A2ARM1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms