Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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