Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms