Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms