Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabreA2AMW3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms