Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms