Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms